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LCMS是常用的監(jiān)測手段，下面對其一些基礎(chǔ)知識進(jìn)行介紹，內(nèi)容整理自網(wǎng)絡(luò)，版權(quán)歸原作者所有。 質(zhì)譜分析是先將物質(zhì)離子化，按離子的質(zhì)荷比分離，然后測量各種離子譜峰的強(qiáng)度而實現(xiàn)分析目的的一種分析方法。
質(zhì)譜分析原理
分子在真空中被電子轟擊，形成離子，通過電磁場按不同m/e分離；質(zhì)譜圖的表示方法：以棒圖形式表示離子的相對峰度隨m/e的變化；提供的信息：分子離子及碎片離子的質(zhì)量數(shù)及其相對峰度，提供分子量，元素組成及結(jié)構(gòu)的信息，可以用于測定相對分子質(zhì)量、化合物分子式及結(jié)構(gòu)式。質(zhì)譜樣品：適合分析相對分子質(zhì)量為50~2000的液體、固體有機(jī)化合物樣品，試樣應(yīng)盡可能為純凈的單一組分。
以下是FT-ICR質(zhì)譜儀工作過程：
離子產(chǎn)生
離子收集
離子傳輸
FT-ICR質(zhì)譜的分析器是一個具有均勻（超導(dǎo)）磁場的空腔，離子在垂直于磁場的圓形軌道上作回旋運動，回旋頻率僅與磁場強(qiáng)度和離子的質(zhì)荷比有關(guān)，因此可以分離不同質(zhì)荷比的離子，并得到質(zhì)荷比相關(guān)的圖譜。
離子回旋運動
傅立葉變換
相關(guān)概念
離子豐度（Abundance of ions）：檢測器檢測到離子信號強(qiáng)度。
相對離子豐度（Relative abundance of ions）：以質(zhì)譜圖中指定質(zhì)荷比范圍內(nèi)最強(qiáng)峰（基峰）的強(qiáng)度為100%。其它離子峰對其歸一化所得到的強(qiáng)度。標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜圖均以離子相對豐度值為縱坐標(biāo)。離子的豐度與物質(zhì)的含量相關(guān)，因此是質(zhì)譜定量的基礎(chǔ)。
EI：電子轟擊源質(zhì)譜，常用于GC-MS系統(tǒng)。
API：大氣壓電離源質(zhì)譜，常用于LC-MS系統(tǒng)。
MALDI：基質(zhì)輔助激光解吸電離源質(zhì)譜，常用于生物大分子分析。
HPLC：高效液相色譜法（High Performance Liquid Chromatography \ HPLC）又稱“高壓液相色譜”、“高速液相色譜”、“高分離度液相色譜”、“近代柱色譜”等。高效液相色譜是色譜法的一個重要分支，以液體為流動相，采用高壓輸液系統(tǒng)，將具有不同極性的單一溶劑或不同比例的混合溶劑、緩沖液等流動相泵入裝有固定相的色譜柱，在柱內(nèi)各成分被分離后，進(jìn)入檢測器進(jìn)行檢測，從而實現(xiàn)對試樣的分析。
UPLC：超高效液相色譜（Ultra Performance Liquid Chromatography，UPLC）色譜理論認(rèn)為提高色譜柱的效能（efficiency）就能增加儀器的解析度（resolution），而運用粒徑低于2μm的小顆粒無疑是增加效能的好方法。但減小固定相的粒度以增加色譜柱效能一直是色譜儀器科學(xué)的瓶頸，因為小顆粒不僅要求系統(tǒng)能承受高于目前極限壓力（比如6000psi/400bar），需要更小的系統(tǒng)體積（死體積），并且需要能適應(yīng)可能只有幾秒峰寬的高速檢測器。
ESI：Electron Spray Ionization的縮寫，意思是電噴霧離子源，是質(zhì)譜儀中較為常用的一種離子化方式。電噴霧離子源屬于一種軟電離源,能使大質(zhì)量的有機(jī)分子生成帶多電荷的離子。
APCI：Atmospheric Pressure Chemical Ionization的縮寫，大氣壓化學(xué)電離源 APCI是20世紀(jì)90年代后使用的液相色譜和質(zhì)譜聯(lián)用的接口技術(shù)之一。溶液在氣流作用下形成氣溶膠，蒸發(fā)，電暈放電使溶劑電離，電子轉(zhuǎn)移或電子捕獲，使樣品帶電。
Mass Spectrum (MS) 相關(guān)知識
離子在電場中加速，在磁場中偏轉(zhuǎn)。正離子源適用于堿性化合物: 含氮化合物更容易粘附氫正離子，在正離子源中容易出分子離子峰。負(fù)離子源適合酸性化合物: 酸性化合物更容易轟擊掉氫正離子，如酸，酚類化合物。
一、 加減分子量峰
常用的MS或者LCMS檢測為ESI電離源，當(dāng)一種化合物不出MS或者M(jìn)S異常的還可以作ACPI電離源檢測，可能會得到相應(yīng)的結(jié)果。
加分子量峰: M+1(H+); M+23(加Na+); 2M+23(兩分子共用一個鈉離子)。
減分子量峰: M-56(脫叔丁基)和M-100(脫Boc),非常常見; M-16(脫NH3)和M-17(脫水)以及(M+2)/2(在電場里面粘附上2個正離子)， 含烯丙基或芐基的雜原子化合物，很容易出烯丙基或芐基的正離子碎片峰，比較常見。
常見的離子片段
正模式
原因
M+14
在LCMS中羧酸與甲醇成酯，或其他多一個碳的情況
M+18
加NH4
M+19
水合
M+23
加鈉離子
M+33
加甲醇
M+39
加鉀離子
M+42
加乙腈
M+64
加乙腈加鈉離子
2M+1
二聚+氫離子，倍峰
2M+23
二聚+鈉離子
一系列相差42的峰
可能為石蠟油污染
一系列相差44的峰
可能為聚乙二醇污染
M-16
脫掉NH3
M-17
脫水
M-44
羧酸和含Cbz的分子常見，重排后脫CO2
M-56
含Boc的分子常見，脫叔丁基
M-100
含Boc的分子常見，脫Boc
(M+2)/2
分子絡(luò)合兩個氫離子，半峰
負(fù)模式
原因
M-1
[M-H]-
M+X
[M+X]-, X=溶劑或緩沖溶液的陰離子
M+S-1
[M+S-H]-, S=溶劑
詳細(xì)內(nèi)容點擊 ---》有機(jī)合成路線：LCMS常出現(xiàn)的干擾離子峰總結(jié)
二、同位素峰
特別注意精確分子量和摩爾分子量的區(qū)別： 質(zhì)譜分子量都是用同位素質(zhì)量計算得到的。 Chemdraw里精確分子量是高分辨的最高強(qiáng)度峰，是用組成該分子的所有原子在天然界中豐度最高的同位素的質(zhì)量加和得到的，對有多個同位素的原子，同一個分子碎片就有可能出現(xiàn)多個質(zhì)譜峰。比如下圖中的例子：氯原子有原子量為34.97和36.97兩個同位素, 而且天然豐度都是接近3;1, 其質(zhì)譜圖中就會出現(xiàn)155.05和157.05兩個分子離子峰, 且強(qiáng)度比接近3:1。自然界中的元素都是各個同位素的混合，因此摩爾分子量是按自然界中同位素的比例平均得到的。平時測MS時，可以直接通過 Chemdraw（手機(jī)APP--Kingdraw也挺好用）計算出質(zhì)譜的分子離子峰。
同位素峰的一個常見應(yīng)用就是可以直接判斷所測的化合物是否含有Cl或Br等具有明顯同位素的原子。常見氯和溴同位素的表現(xiàn): 一個氯峰高比M+2/M=1/3; 一個溴為峰高比M+2/M=1/1), 同時含有多個同位素的表現(xiàn)可以用Chemdraw精確模擬。
另外一些特殊情況下可以通過同位素峰判斷是否反應(yīng)完全，如下圖所示：A經(jīng)過偶聯(lián)生成B，利用LCMS監(jiān)測反應(yīng)，如不仔細(xì)看同位素峰，就會誤判原料沒有反應(yīng)。正模式下, 原料A[M+H]: 268, 270; 產(chǎn)物B只有[M+H]: 270。
HPLC相關(guān)注意事項
基本原理: 實驗室常過的硅膠柱和TLC都是是正相柱，常見的HPLC是反相柱兩者在出峰時間上大體相反，即極性大的化合物先出峰，極性小的后出峰。但也不是所有情況都相反，例如有些在TLC板上極性小的化合物卻含有水溶性好的基團(tuán)，出峰位置很可能會提前。
HPLC的應(yīng)用: 測定反應(yīng)液中各個組分含量，測定化合物純度，監(jiān)控反應(yīng)是否完全。參照出峰時間和出峰面積來判斷原料轉(zhuǎn)化率和產(chǎn)物生成量。
流動相方法:0-60，5-95，10-80，30-90等等，可以讓分析人員設(shè)置: 。0-60，5-95，10-80，30-90這些數(shù)字都是指乙腈的含量，乙腈含量越大，流動相極性越小，出峰越靠前，常用的是10-80的方法，根據(jù)10-80方法的出峰時間換用不同的方法。有機(jī)流動相也可以用甲醇，水相，正模式通常用0.05%的三氟乙酸水溶液， 負(fù)模式常用 0.02%或乙酸銨鹽水溶液。
特殊HPLC: 堿性柱和中性柱在酸性柱下不能分開的情況下使用 ELSD在紫外顯色弱或者沒有的情況，氣相柱適用于沸點低于300攝氏度的化合物。
使用注意: 峰高在1000-3000mAU之間，出峰時間在整個時間的1/4到3/4，峰寬小于0.5分鐘，顯示的純度是可信度比較大。
查看LCMS步驟:1)、先看MS部分，看有沒有所要離子峰，并且要看清楚峰是否有所需化合物MS信號，判斷該峰是否掩蓋周圍的峰。2)、再看HPLC部分，看含量有多少，并且要看清楚該化合物是否有強(qiáng)的HPLC信號，是否掩蓋周圍的峰; 3)、兩者結(jié)合起來看，判斷兩個峰是否對應(yīng)，推測反應(yīng)進(jìn)行的程度和反應(yīng)產(chǎn)生的雜質(zhì)。
注意事項：
1、 LCMS的注意要點:LCMS是HPLC和MS的結(jié)合，HPLC和MS的出峰時間是有差異的，由于反應(yīng)液是先通過HPLC分別走出各個峰，然后分別進(jìn)入MS系統(tǒng)，因此MS的出峰時間比HPLC的出峰時間稍微滯后(具體滯后時間和具體機(jī)器有關(guān))，特別是反應(yīng)液比較復(fù)雜的情況下一定要注意，不要將MS的峰對應(yīng)了錯誤的HPLC峰，導(dǎo)致反應(yīng)判斷錯誤。另外不能只靠LCMS檢測反應(yīng)，特別是不點TLC，直接做LCMS。應(yīng)該結(jié)合其他手段來確定化合物(特別是NMR).
2、 正 負(fù)離子源分別適合什么分子: 正離子源適用于堿性化合物，如含氮化合物更容易粘附氫正離子，在正離子源中容易出分子離子峰。負(fù)離子源適合酸性化合物，酸性化合物更容易被轟擊掉氫正離子，如酸，酚類化合物。所以要根據(jù)需要監(jiān)測的化合物的性質(zhì)來決定使用哪種離子源。
3、MS僅為輔助檢測手段，只可進(jìn)行粗略判斷反應(yīng)液中是否有該化合物，絕對不能從MS出峰強(qiáng)度來判斷反應(yīng)液中樣品的含量。如果兩個結(jié)構(gòu)非常類似的化合物，HPLC出峰位置相同時，并且具有相同的官能團(tuán)的話，可以通過MS出峰強(qiáng)度粗略判斷含量，可以考慮通過點板或HNMR確認(rèn)比例。
4、 0-60，5-95，10-80，30-90這些方法是指什么意思:0-60，5-95，10-80，30-90這些數(shù)字都是指乙腈的含量，乙腈含量越大，流動相極性越小，出峰越靠前，常用的是10-80的方法，根據(jù)10-80方法的出峰時間換用不同的方法。
6. 其他注意事項：一、甲苯等在LCMS上有吸收峰的試劑作為溶劑的反應(yīng)，在送LCMS監(jiān)測前一定要先除掉，不然會影響對反應(yīng)的判斷，特別是溶劑峰剛好和產(chǎn)物或原料峰出在一個位置時。二、當(dāng)點板和LCMS有很大出入時，LCMS要換其他方法重新監(jiān)測，切換正負(fù)模式或梯度，防止峰的重疊。三、一般監(jiān)測前，測樣要濾膜過濾，所以要確保所測樣品要完全溶解。
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